«Оценка эффективности алгоритма профилактики наследственных болезней путем консультирования, генетического и социолого-психологического обследования семей с высоким риском передачи частых наследственных заболеваний детям»,
выполняемого в рамках договора №2-H от 28.11.2022
1. Цель и задачи проекта
Цель проекта:
1. Выполнение комплексного генетического обследования 60 семей с повышенным риском наследования частых моногенных заболеваний (муковисцидоз, фенилкетонурия, спинальная мышечная атрофия), находящихся на этапе планирования беременности;
2. Социолого-психологическое исследование востребованности преконцепционных генетических тестов среди общей популяции и в наследственно отягощенных семьях.
Задачи проекта:
1. Разработать алгоритм отбора участников исследования для участия в научном исследования с учетом социального, психологического, географического и иных статусов пациента (ов);
2. По результатам медико-генетического консультирования, сформировать план генетического обследования 60 семей с повышенным риском наследования частых моногенных заболеваний (муковисцидоз, фенилкетонурия, спинальная мышечная атрофия), находящихся на этапе планирования беременности;
3. Оценить готовность пациентов данных групп к участию в преконцепционном скрининге; оценку провести в формате глубинного интервью (в случае согласия участников исследования) привлечением профессиональной команды для социолого-психологического исследования, по согласованию с Заказчиком и силами сторонней организации, финансируемой Заказчиком;
4. Выполнить поиск патогенных вариантов в гене CFTR/PAH/SMN1 у супруга (супруги) участника исследования или других родственников участника, согласившегося участвовать в исследовании, с установленным диагнозом «муковисцидоз»/«фенилкетонурия»/«спинальная мышечная атрофия» или супруга (супруги) носителя патогенного варианта в генах CFTR/PAH/SMN1;
5. В случае обнаружении патогенных вариантов у супругов разработать индивидуальный план профилактики в зависимости от общего анамнеза и соматического статуса супругов.
6. Принять участие в реализации социологического исследования востребованности генетических исследований, направленных на профилактику рождения детей с наследственной патологией, среди наследственно отягощенных семей, оценивая влияние таких факторов как консультирование одного супруга/семьи, источник информации о таких тестах, влияние конкретных специалистов на согласие в участии в тесте, особенностях финансирования данной услуги;
7. Принять участие в реализации социологического исследования по оценке мотивации к проведению генетических исследований в общей популяции;
8. Сформулировать алгоритм консультирования и обследования на основе полученных генетических и социологических данных.
2. Содержание проекта
Подготовительный этап.
Исполнитель определяет списки участников исследования различных нозологий для приглашения к участию в проекте. Количество нозологий не менее 3 (включая муковисцидоз, фенилкетонурию, спинальную мышечную атрофию). Количество регионов – не менее 2. Количество участников для первичного контактирования – не менее 120. Описываются процедура вовлечения в научное исследования. При необходимости корректируется техническое задание.
Первый этап. Обследование семей.
Выполнение генетического обследование 60 семей включает первичное и повторное медико-генетическое консультирование и лабораторное исследование супругов участников исследования с установленным диагнозом моногенных заболеваний (муковисцидоз, фенилкетонурия, спинальная мышечная атрофия), а также супругов носителей патогенных вариантов гена CFTR/PAH/SMN1 для исключения статуса бессимптомного носительства ими патогенных вариантов. Во время медико-генетической консультации будут проанализированы данные клинических и лабораторных исследований пациента, результаты исследований будут соотнесены с клинической картиной пациентов, будет рассчитан риск наследования заболевания и составлен план обследования их супругов.
Одновременно с медико-генетическим консультированием будет выполнено анкетирование супругов и проведено психо-социологического исследование при условии согласия указанных лиц. Психологическое обследование может проводиться по показаниям.
Лабораторное генетическое обследование будет выполняться в двух вариантах:
Вариант № 1. Данный вариант будет применяться при обследовании супругов носителей патогенных вариантов генов, ответственных за развитие моногенного заболевания (муковисцидоз, фенилкетонурия, спинальная мышечная атрофия) и включать следующие исследования:
1. «Определение частых мутаций в гене CFTR/PAH/SMN1»
Вариант № 2. Данный вариант будет применяться при обследовании супругов участников исследования с установленным диагнозом моногенной болезни и включать следующие исследования:
А) муковисцидоз
1. «Секвенирование экзонов гена CFTR»
2. «Поиск крупных делеций/дупликаций в гене CFTR»
Б) фенилкетонурия
1. «Секвенирование кодирующих областей гена PAH
В) спинальная мышечная атрофия
1. «Анализ делеции 7 экзона в гене SMN1»
Предложенная схема выбора молекулярно-генетических исследований снизит расходы на реализацию проекта и при этом позволит эффективно выполнить поставленные задачи по исключению носительства патогенных вариантов в гене CFTR/PAH/SMN1 в семьях с повышенным риском наследования распространенных моногенных заболеваний.
Последним шагом данного этапа станет медико-генетическое консультирование по результатам проведённых лабораторных исследований, на котором будет предложен индивидуальный план профилактики патологии в зависимости от общего анамнеза и соматического статуса супругов.
Социологическое исследование будет выполняться параллельно в рамках периода генетического обследования. Интервью могут проводиться как офлайн, так и онлайн – по договоренности с каждым из участников проекта. Представитель Исполнителя обязуется сотрудничать со специалистом от Заказчика, ответственными за социологическое обследование. Для того, чтобы все участники исследования могли принять участие в социологическом интервью, будет разработан маршрутный лист с указанием специалистов и услуг/манипуляций/тестов, которые может пройти каждый участник исследования. Таким образом, участник может сам выбрать время для социологического интервью.
Для интервью требуется кабинет и выделенное время. Каждое интервью занимает около 60 минут. Предусмотрено разработать журнал для записи, где участники исследования будут записываться на интервью, а также будут содержаться контакты для связи с социологом по поводу онлайн-интервью.
На первом этапе будут проведены 15 полуструктурированных интервью с участниками проекта (выборка из 60 семей с рисками наиболее распространенных наследственных заболеваний) на основе разработанной программы интервью с записью интервью на диктофон при согласии участника. Некоторые сюжеты для интервью:
- описание ситуации пациента и мотивации участия в проекте;
- реализуемые в семье репродуктивные стратегии, наличие репродуктивного опыта (история), репродуктивные планы;
- знание о возможностях генетических исследований, отношение к генетическому знанию в целом, переживания и опасения, связанные с генетической информацией;
- наличие проблем со здоровьем – своем или ближайших родственников, отношение к здоровью;
- выявление системы ценностей;
- используемые источники информации;
- опыт взаимодействия с системой здравоохранения (если есть, будет уточняться);
- и т. д.
Данные, полученные в ходе интервью, будут транскрибированы. Полученные транскрипты обработаны в соответствии с целью и задачами исследования. На данном этапе будут получены насыщенные (густые) данные, не подлежащие количественной обработке напрямую. Однако, они позволят описать процесс принятия решений об участии в преконцепционном скрининге среди групп риска и разработать социологические категории для реализации второго этапа исследования.
Второй этап. Профилактика рождения ребенка с моногенным заболеванием (муковисцидоз, фенилкетонурия, спинальная мышечная атрофия).
Профилактические меры будут включать в себя либо определение носительства патогенных вариантов в гене CFTR/PAH/SMN1 у плода в случае наступления естественной беременности (инвазивная пренатальная диагностика), либо преимплантационное генетическое тестирование (ПГТ-М) биоптата трофэктодермы эмбрионов при выполнении вспомогательных репродуктивных технологий.
Вариант №1. Инвазивная пренатальная диагностика
При сохранной фертильности в семье и/или наличии противопоказаний к ЭКО, семье может быть рекомендовано выполнение инвазивной пренатальной диагностики (ИПД) обычно на 10–11 неделе беременности (хорионбиопсия). Перед ИПД проводится предварительная консультация врача акушера-гинеколога с выполнением ультразвукового исследования плода. Материал, взятый у пациентки во время инвазивной процедуры, анализируется на наличие патогенного варианта/вариантов с помощью ранее разработанной молекулярно-генетической тест-системы. При выявлении патологического генотипа семья информируется о возможности прерывания беременности.
Вариант №2. ЭКО с ПГТ-М
Альтернативой ИПД служит применение программы ЭКО с ПГТ-М. Исследование выполняется в 2 стадии:
а) подготовительный этап
На данном этапе будет выполнено генетическое обследование родителей для выявления информативных генетических маркеров, установления родительских гаплотипов, гаплотипов «высокого» и «низкого» риска», а также апробация ранее разработанной тест-системы для конкретной семьи.
б) непосредственное ПГТ-М
На пятый день после инсеминации проводится биопсия бластоцисты и 5–10 клеток трофэктодермы, взятых из бластоцист, направляются на преимплантационное генетическое исследование. После завершения исследования осуществляется селективный перенос в слизистую оболочку матки только здорового эмбриона (здоровых эмбрионов).
Последним шагом данного этапа станет медико-генетическое консультирование по результатам проведённых лабораторных исследований (ПД или ПГТ-М).
Третий этап. Участие в подготовке и проведении социологического исследования общей популяции.
В рамках третьего этапа Исполнитель осуществляет экспертизу социологической анкеты для опроса граждан. Цель экспертизы – проверить правильность использования терминов и понятий в сфере медицинской помощи и генетики.
На основе результатов, полученных в ходе первого этапа социологического исследования (интервью с семьями), будут разработаны техническое задание и анкета для проведения телефонного опроса в общей популяции по репрезентативной выборке (пол, возраст) и проведен сам опрос (с привлечением специализированной компании).
В качестве генеральной совокупности могут быть рассмотрены:
1) Все население России
2) Население Северо-Западного федерального округа
3) Населения Санкт-Петербурга.
Предполагаем, что целевой группой второго этапа могут выступать россияне 18 – 45 лет (фертильный возраст для женщин), либо россияне старше 18 лет.
На втором этапе количественной проверке будут подвергаться гипотезы, сформулированные на основе обработки качественных данных, полученных в ходе интервью. Кроме того, важно выявить и описать социальные установки в отношении преконцепционного скрининга и генетического знания в целом среди населения. В частности, важно выявить:
1) степень осведомленности различных социально-демографических групп о возможностях генетической диагностики, а также используемые источники информации;
2) степень осведомленности о своих генетических рисках (рисках передачи наследственных заболеваний), наличие опыта генетического тестирования, страхи и переживания, связанные со знанием генетических рисков;
3) готовность участвовать в преконцепционном скрининге (представления о его важности или, напротив, бесполезности);
4) факторы, влияющие на такую готовность:
- состояние здоровья, оценка состояния здоровья
- используемые репродуктивные стратегии, наличие репродуктивных проблем, знание семейной истории (родственники с проблемами со здоровьем)
- знание своих генетических рисков, наличие хронических заболеваний
- особенности принятия решений в семье и делегирования ответственности
- финансово-экономические возможности
- ценностная система
- доверие системе здравоохранения, удовлетворенность медицинской помощью, готовность сотрудничать с врачами
- и т. д.
Данные телефонного опроса будут обработаны с помощью методов статистического анализа (корреляционный анализ Спирмена, Пирсона, Эта; сравнение средних, факторный анализ, кластерный анализ). Будут сформулированы выводы о готовности населения (различных социальных групп) к участию в преконцепционном скрининге, а также факторах, влияющих на такую готовность.
4 этап. Подготовка проекта методических рекомендаций по преконцепционному скринингу пар с отягощённой семейной наследственностью. В рекомендациях будет сформулирован алгоритм консультирования и обследования на основе полученных генетических и социологических данных во время проведения научно-исследовательской работы. Подготовка научной публикации по результатам проекта.
3. Предполагаемые (ожидаемые) результаты
1. Будет выполнен поиск патогенных вариантов в гене CFTR/PAH/SMN1 у супруга (супруги) участника исследования или других родственников участника, согласившегося участвовать в исследовании, с установленным диагнозом «муковисцидоз»/«фенилкетонурия»/«спинальная мышечная атрофия» или супруга (супруги) носителя патогенного варианта в генах CFTR/PAH/SMN1;
2. В случае обнаружении патогенных вариантов у супругов будет разработан индивидуальный план профилактики в зависимости от общего анамнеза и соматического статуса супругов.
3. Будет реализовано социологическое исследование востребованности генетических исследований, направленных на профилактику рождения детей с наследственной патологией, среди наследственно отягощенных семей, оценивая влияние таких факторов как консультирование одного супруга/семьи, источник информации о таких тестах, влияние конкретных специалистов на согласие в участии в тесте, особенностях финансирования данной услуги;
4. Будет реализовано социологическое исследование по оценке мотивации к проведению генетических исследований в общей популяции;
5. Будет сформулирован алгоритм консультирования и обследования на основе полученных генетических и социологических данных;
6. Будет подготовлен проект методических рекомендаций по преконцепционному скринингу пар с отягощённой семейной наследственностью;
7. Будет подготовлена научная публикация по результатам проекта.
4. Описание групп исследования
• супруга (супруг) пациента с установленным диагнозом «муковисцидоз»/«фенилкетонурия»/«спинальная мышечная атрофия»
или
• супруга (супруг) носителя идентифицированного патогенного варианта в гене CFTR/PAH/SMN1
В обследование могут быть включены родственники пробанда I и II степени родства, планирующие беременность, и их партнеры (супруги).
Списки участников исследования (пациента) согласовываются в обязательном порядке с БФ «Острова».
5. Методы исследования
1. Молекулярно-генетические методы исследования:
1.2. Полимеразная цепная реакция/полимеразная цепная реакция с последующим рестрикционным анализом (ПЦР/ПДРФ)
1.3. Мультиплексная лигазная реакция
1.4. Секвенирование по Сэнгеру
1.5. Метод секвенирования следующего поколения (таргетное)
2. Социологические методы исследования:
2.1. Анкетные опросы
2.2. Интервью
6. Безопасность исследования
Забор образцов будет производиться по стандартным методикам забора венозной и пуповинной крови. Хранение и транспортировка образцов будет осуществляться в соответствии нормами, установленными статьей 40 Федерального Закона №15-ФЗ «О санитарно-эпидемиологическом благополучии населения».
7. Продолжительность исследования: 28.11.2022- 26.06.2025 гг.